El diseño del museo se lo debemos a otro gran maestro de las artes venezolanas, el arquitecto Carlos Raúl Villanueva. En esta obra se refleja, una vez más, su capacidad creadora capaz de integrar el diseño arquitectónico con la pintura, la escultura el paisaje y el hombre.
En el museo se exhiben importantes obras de la colección particular que fue el Maestro Soto durante los años 50 y 60 durante su estadía en Europa. Aquí se podrán apreciar obras de tendencias artísticas como: el estructuralismo, el neoplasticismo, el arte óptico, el cinético, monocromático, arte geométrico y arte concreto, entre otros, de más de 130 artistas de todo el mundo. Además de importantes obras del propio Jesús Soto que tiene dos pabellones exclusivos para sus creaciones.